Kun:LabNotes/ASE/2007-12-31: Difference between revisions

From ZhangLabWiki
Jump to navigation Jump to search
Line 4: Line 4:
     10x buffer        3ul                3ul              3ul
     10x buffer        3ul                3ul              3ul
     H2O (DEPC)        17ul                10ul              0ul
     H2O (DEPC)        17ul                10ul              0ul
    DNase I(2u/ul)    2ul                2ul              2ul
    RNase Inhibitor  0.5ul              0.5ul            0.5ul
    37C 30min -> 75C 10min -> Cleanup with RNeasy columns
==Exp.2 Also process RNAs from Hybrid1, Hybrid2, BJ Fibroblast==
                      Hybrid1            Hybrid2        BJ Fibroblast
    total RNA      1.9ug/ul x8ul    570ng/ul x 20ul  72ng/ul x 52ul
    10x buffer        3ul                3ul              6ul
    H2O (DEPC)        17ul                5ul              0ul
     DNase I(2u/ul)    2ul                2ul              2ul
     DNase I(2u/ul)    2ul                2ul              2ul
     RNase Inhibitor  0.5ul              0.5ul            0.5ul
     RNase Inhibitor  0.5ul              0.5ul            0.5ul
     37C 30min -> 75C 10min -> Cleanup with RNeasy columns
     37C 30min -> 75C 10min -> Cleanup with RNeasy columns

Revision as of 23:24, 31 December 2007

Exp.1 Make gDNA-free cDNA from GM20431, GC1EP and Hues6

                  GM20431(06/04/07)   GC1EP(06/14/07) Hues6(05/14/07)
   total RNA       1.25ug/ul x8ul     645ng/ul x 15ul  270ng/ul x 25ul
   10x buffer         3ul                 3ul               3ul
   H2O (DEPC)        17ul                10ul               0ul
   DNase I(2u/ul)     2ul                 2ul               2ul
   RNase Inhibitor  0.5ul               0.5ul             0.5ul
   37C 30min -> 75C 10min -> Cleanup with RNeasy columns

Exp.2 Also process RNAs from Hybrid1, Hybrid2, BJ Fibroblast

                     Hybrid1            Hybrid2         BJ Fibroblast
   total RNA       1.9ug/ul x8ul     570ng/ul x 20ul   72ng/ul x 52ul
   10x buffer         3ul                 3ul               6ul
   H2O (DEPC)        17ul                 5ul               0ul
   DNase I(2u/ul)     2ul                 2ul               2ul
   RNase Inhibitor  0.5ul               0.5ul             0.5ul
   37C 30min -> 75C 10min -> Cleanup with RNeasy columns