Calendar/2011-3-28: Difference between revisions
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===Qubit Quantification=== | ===Qubit Quantification=== | ||
*dilute 25ul 200X dye with 4975ul buffer | *dilute 25ul 200X dye with 4975ul buffer | ||
{| {{table}} | |||
| Sample||Concentration in the Qubit||||µL used||Dilution||Sample Concentration|| | |||
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| 1||37.2||ng/mL||1||200||7.44||µg/mL | |||
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| 2||103||ng/mL||1||200||20.6||µg/mL | |||
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| 3||Out Of Range|||||||||| | |||
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| 4||27||ng/mL||1||200||5.4||µg/mL | |||
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| 5||47.8||ng/mL||1||200||9.56||µg/mL | |||
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| 6||12.7||ng/mL||1||200||2.55||µg/mL | |||
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| 7||Out Of Range|||||||||| | |||
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| 8||Out Of Range|||||||||| | |||
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| 9||Out Of Range|||||||||| | |||
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| 10||Out Of Range|||||||||| | |||
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| 11||Out Of Range|||||||||| | |||
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| 17||Out Of Range|||||||||| | |||
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| 18||Out Of Range|||||||||| | |||
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| 20||Out Of Range|||||||||| | |||
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| 21||Out Of Range|||||||||| | |||
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===Tagmentation Reaction=== | ===Tagmentation Reaction=== |
Revision as of 21:08, 28 March 2011
Library Construction on sample 1-21 from Dr. Heller
Qubit Quantification
- dilute 25ul 200X dye with 4975ul buffer
Sample | Concentration in the Qubit | µL used | Dilution | Sample Concentration | ||
1 | 37.2 | ng/mL | 1 | 200 | 7.44 | µg/mL |
2 | 103 | ng/mL | 1 | 200 | 20.6 | µg/mL |
3 | Out Of Range | |||||
4 | 27 | ng/mL | 1 | 200 | 5.4 | µg/mL |
5 | 47.8 | ng/mL | 1 | 200 | 9.56 | µg/mL |
6 | 12.7 | ng/mL | 1 | 200 | 2.55 | µg/mL |
7 | Out Of Range | |||||
8 | Out Of Range | |||||
9 | Out Of Range | |||||
10 | Out Of Range | |||||
11 | Out Of Range | |||||
12 | Out Of Range | |||||
13 | Out Of Range | |||||
14 | Out Of Range | |||||
15 | Out Of Range | |||||
16 | Out Of Range | |||||
17 | Out Of Range | |||||
18 | Out Of Range | |||||
19 | Out Of Range | |||||
20 | Out Of Range | |||||
21 | Out Of Range |
Tagmentation Reaction
- Prior to assembling the reaction, briefly centrifuge the 5X Nextera Reaction Buffer and Nextera Enzyme Mix tubes to assure that the reagents are at the bottom of the tubes.
- Assemble the following reaction components on ice, in the order listed:
x µl Nuclease-Free Water 50 ng Target DNA (in T10E1 Buffer [10 mM Tris-HCl (pH 7.5), 1 mM EDTA]) 4 µl 5X Nextera Reaction Buffer LMW or HMW (see Important Considerations, no. 1, p. 3) 1 µl Nextera Enzyme Mix (Illumina-compatible) 20 µl Total reaction volume