r2 Matrix (?)
CpG Pair 1 | CpG Pair 2 | Distance | TT Count | TC Count | T* Count | CT Count | CC Count | C* Count | *T Count | *C Count | R Value | mafA | mafB |
6599655 | 6599658 | 3 | 132 | 50 | 182 | 129 | 567 | 696 | 261 | 617 | 0.48 | 0.21 | 0.30 |
6599655 | 6599667 | 12 | 76 | 54 | 130 | 57 | 469 | 526 | 133 | 523 | 0.47 | 0.20 | 0.20 |
6599655 | 6599670 | 15 | 56 | 62 | 118 | 34 | 459 | 493 | 90 | 521 | 0.45 | 0.19 | 0.15 |
6599655 | 6599679 | 24 | 42 | 41 | 83 | 36 | 283 | 319 | 78 | 324 | 0.40 | 0.21 | 0.19 |
6599655 | 6599686 | 31 | 29 | 23 | 52 | 26 | 173 | 199 | 55 | 196 | 0.42 | 0.21 | 0.22 |
6599655 | 6599688 | 33 | 25 | 15 | 40 | 17 | 160 | 177 | 42 | 175 | 0.52 | 0.18 | 0.19 |
6599655 | 6599692 | 37 | 11 | 9 | 20 | 3 | 73 | 76 | 14 | 82 | 0.59 | 0.21 | 0.15 |
6599658 | 6599667 | 9 | 105 | 116 | 221 | 41 | 479 | 520 | 146 | 595 | 0.46 | 0.30 | 0.20 |
6599658 | 6599670 | 12 | 70 | 131 | 201 | 31 | 464 | 495 | 101 | 595 | 0.37 | 0.29 | 0.15 |
6599658 | 6599679 | 21 | 51 | 85 | 136 | 34 | 318 | 352 | 85 | 403 | 0.33 | 0.28 | 0.17 |
6599658 | 6599686 | 28 | 45 | 61 | 106 | 19 | 212 | 231 | 64 | 273 | 0.41 | 0.31 | 0.19 |
6599658 | 6599688 | 30 | 38 | 51 | 89 | 16 | 198 | 214 | 54 | 249 | 0.42 | 0.29 | 0.18 |
6599658 | 6599692 | 34 | 17 | 33 | 50 | 9 | 124 | 133 | 26 | 157 | 0.35 | 0.27 | 0.14 |
6599658 | 6599695 | 37 | 7 | 20 | 27 | 6 | 88 | 94 | 13 | 108 | 0.26 | 0.22 | 0.11 |
6599667 | 6599670 | 3 | 103 | 123 | 226 | 53 | 873 | 926 | 156 | 996 | 0.46 | 0.20 | 0.14 |
6599667 | 6599679 | 12 | 75 | 112 | 187 | 57 | 698 | 755 | 132 | 810 | 0.37 | 0.20 | 0.14 |
6599667 | 6599686 | 19 | 69 | 91 | 160 | 56 | 577 | 633 | 125 | 668 | 0.38 | 0.20 | 0.16 |
6599667 | 6599688 | 21 | 69 | 79 | 148 | 47 | 564 | 611 | 116 | 643 | 0.43 | 0.19 | 0.15 |
6599667 | 6599692 | 25 | 51 | 76 | 127 | 33 | 478 | 511 | 84 | 554 | 0.40 | 0.20 | 0.13 |
6599667 | 6599695 | 28 | 41 | 71 | 112 | 29 | 434 | 463 | 70 | 505 | 0.37 | 0.19 | 0.12 |
6599667 | 6599699 | 32 | 37 | 54 | 91 | 28 | 335 | 363 | 65 | 389 | 0.38 | 0.20 | 0.14 |
6599667 | 6599701 | 34 | 31 | 43 | 74 | 31 | 251 | 282 | 62 | 294 | 0.33 | 0.21 | 0.17 |
6599667 | 6599706 | 39 | 10 | 15 | 25 | 5 | 95 | 100 | 15 | 110 | 0.43 | 0.20 | 0.12 |
6599670 | 6599679 | 9 | 66 | 77 | 143 | 78 | 845 | 923 | 144 | 922 | 0.38 | 0.13 | 0.14 |
6599670 | 6599686 | 16 | 69 | 60 | 129 | 69 | 725 | 794 | 138 | 785 | 0.44 | 0.14 | 0.15 |
6599670 | 6599688 | 18 | 62 | 60 | 122 | 69 | 699 | 768 | 131 | 759 | 0.41 | 0.14 | 0.15 |
6599670 | 6599692 | 22 | 43 | 55 | 98 | 55 | 615 | 670 | 98 | 670 | 0.36 | 0.13 | 0.13 |
6599670 | 6599695 | 25 | 33 | 56 | 89 | 53 | 562 | 615 | 86 | 618 | 0.29 | 0.13 | 0.12 |
6599670 | 6599699 | 29 | 35 | 40 | 75 | 46 | 462 | 508 | 81 | 502 | 0.36 | 0.13 | 0.14 |
6599670 | 6599701 | 31 | 33 | 30 | 63 | 53 | 372 | 425 | 86 | 402 | 0.35 | 0.13 | 0.18 |
6599670 | 6599706 | 36 | 15 | 18 | 33 | 20 | 201 | 221 | 35 | 219 | 0.35 | 0.13 | 0.14 |
6599679 | 6599686 | 7 | 85 | 67 | 152 | 99 | 1169 | 1268 | 184 | 1236 | 0.44 | 0.11 | 0.13 |
6599679 | 6599688 | 9 | 89 | 59 | 148 | 105 | 1132 | 1237 | 194 | 1191 | 0.46 | 0.11 | 0.14 |
6599679 | 6599692 | 13 | 68 | 64 | 132 | 70 | 1062 | 1132 | 138 | 1126 | 0.45 | 0.10 | 0.11 |
6599686 | 6599688 | 2 | 122 | 82 | 204 | 121 | 1380 | 1501 | 243 | 1462 | 0.48 | 0.12 | 0.14 |
6599686 | 6599692 | 6 | 86 | 95 | 181 | 93 | 1311 | 1404 | 179 | 1406 | 0.41 | 0.11 | 0.11 |
6599686 | 6599695 | 9 | 100 | 70 | 170 | 85 | 1271 | 1356 | 185 | 1341 | 0.51 | 0.11 | 0.12 |
6599686 | 6599699 | 13 | 88 | 69 | 157 | 84 | 1165 | 1249 | 172 | 1234 | 0.47 | 0.11 | 0.12 |
6599686 | 6599701 | 15 | 92 | 47 | 139 | 128 | 1044 | 1172 | 220 | 1091 | 0.46 | 0.11 | 0.17 |
6599686 | 6599706 | 20 | 83 | 33 | 116 | 102 | 859 | 961 | 185 | 892 | 0.50 | 0.11 | 0.17 |
6599686 | 6599716 | 30 | 45 | 18 | 63 | 62 | 489 | 551 | 107 | 507 | 0.48 | 0.10 | 0.17 |
6599688 | 6599692 | 4 | 112 | 122 | 234 | 77 | 1330 | 1407 | 189 | 1452 | 0.46 | 0.14 | 0.12 |
6599688 | 6599695 | 7 | 109 | 110 | 219 | 87 | 1275 | 1362 | 196 | 1385 | 0.46 | 0.14 | 0.12 |
6599688 | 6599699 | 11 | 104 | 96 | 200 | 78 | 1183 | 1261 | 182 | 1279 | 0.48 | 0.14 | 0.12 |
6599688 | 6599701 | 13 | 119 | 68 | 187 | 112 | 1068 | 1180 | 231 | 1136 | 0.50 | 0.14 | 0.17 |
6599688 | 6599706 | 18 | 95 | 58 | 153 | 98 | 881 | 979 | 193 | 939 | 0.47 | 0.14 | 0.17 |
6599688 | 6599716 | 28 | 55 | 35 | 90 | 61 | 516 | 577 | 116 | 551 | 0.46 | 0.13 | 0.17 |
6599692 | 6599695 | 3 | 106 | 84 | 190 | 107 | 1429 | 1536 | 213 | 1513 | 0.47 | 0.11 | 0.12 |
6599692 | 6599699 | 7 | 107 | 73 | 180 | 89 | 1339 | 1428 | 196 | 1412 | 0.51 | 0.11 | 0.12 |
6599692 | 6599701 | 9 | 107 | 57 | 164 | 143 | 1205 | 1348 | 250 | 1262 | 0.46 | 0.11 | 0.17 |
6599692 | 6599706 | 14 | 84 | 53 | 137 | 130 | 1012 | 1142 | 214 | 1065 | 0.41 | 0.11 | 0.17 |
6599692 | 6599716 | 24 | 61 | 30 | 91 | 74 | 649 | 723 | 135 | 679 | 0.48 | 0.11 | 0.17 |
6599695 | 6599699 | 4 | 119 | 93 | 212 | 84 | 1434 | 1518 | 203 | 1527 | 0.52 | 0.12 | 0.12 |
6599695 | 6599701 | 6 | 132 | 67 | 199 | 140 | 1299 | 1439 | 272 | 1366 | 0.50 | 0.12 | 0.17 |
6599695 | 6599706 | 11 | 108 | 61 | 169 | 129 | 1104 | 1233 | 237 | 1165 | 0.46 | 0.12 | 0.17 |
6599695 | 6599716 | 21 | 66 | 45 | 111 | 82 | 746 | 828 | 148 | 791 | 0.44 | 0.12 | 0.16 |
6599699 | 6599701 | 2 | 135 | 74 | 209 | 160 | 1421 | 1581 | 295 | 1495 | 0.47 | 0.12 | 0.16 |
6599699 | 6599706 | 7 | 114 | 65 | 179 | 156 | 1220 | 1376 | 270 | 1285 | 0.44 | 0.12 | 0.17 |
6599699 | 6599716 | 17 | 76 | 49 | 125 | 93 | 873 | 966 | 169 | 922 | 0.45 | 0.11 | 0.15 |
6599699 | 6599729 | 30 | 18 | 28 | 46 | 33 | 336 | 369 | 51 | 364 | 0.29 | 0.11 | 0.12 |
6599701 | 6599706 | 5 | 164 | 103 | 267 | 130 | 1223 | 1353 | 294 | 1326 | 0.50 | 0.16 | 0.18 |
6599701 | 6599716 | 15 | 104 | 84 | 188 | 74 | 891 | 965 | 178 | 975 | 0.49 | 0.16 | 0.15 |
6599701 | 6599729 | 28 | 38 | 42 | 80 | 31 | 366 | 397 | 69 | 408 | 0.42 | 0.17 | 0.14 |
6599701 | 6599734 | 33 | 23 | 26 | 49 | 6 | 233 | 239 | 29 | 259 | 0.56 | 0.17 | 0.10 |
6599706 | 6599716 | 10 | 119 | 127 | 246 | 84 | 942 | 1026 | 203 | 1069 | 0.43 | 0.19 | 0.16 |
6599706 | 6599729 | 23 | 51 | 80 | 131 | 40 | 427 | 467 | 91 | 507 | 0.35 | 0.22 | 0.15 |
6599706 | 6599734 | 28 | 37 | 57 | 94 | 12 | 301 | 313 | 49 | 358 | 0.46 | 0.23 | 0.12 |
6599716 | 6599729 | 13 | 70 | 60 | 130 | 66 | 732 | 798 | 136 | 792 | 0.45 | 0.14 | 0.15 |
6599716 | 6599734 | 18 | 58 | 47 | 105 | 28 | 605 | 633 | 86 | 652 | 0.55 | 0.14 | 0.12 |
6599729 | 6599734 | 5 | 97 | 94 | 191 | 50 | 960 | 1010 | 147 | 1054 | 0.51 | 0.16 | 0.12 |