r2 Matrix (?)
CpG Pair 1 | CpG Pair 2 | Distance | TT Count | TC Count | T* Count | CT Count | CC Count | C* Count | *T Count | *C Count | R Value | mafA | mafB |
57200800 | 57200856 | 56 | 3 | 3 | 6 | 0 | 5 | 5 | 3 | 8 | 0.56 | 0.45 | 0.27 |
57200800 | 57200893 | 93 | 0 | 7 | 7 | 2 | 7 | 9 | 2 | 14 | -0.33 | 0.44 | 0.12 |
57200838 | 57200876 | 38 | 2 | 7 | 9 | 12 | 48 | 60 | 14 | 55 | 0.02 | 0.13 | 0.20 |
57200840 | 57200842 | 2 | 64 | 53 | 117 | 85 | 882 | 967 | 149 | 935 | 0.41 | 0.11 | 0.14 |
57200840 | 57200856 | 16 | 29 | 82 | 111 | 118 | 807 | 925 | 147 | 889 | 0.12 | 0.11 | 0.14 |
57200840 | 57200876 | 36 | 2 | 9 | 11 | 14 | 72 | 86 | 16 | 81 | 0.02 | 0.11 | 0.16 |
57200840 | 57200910 | 70 | 7 | 13 | 20 | 18 | 127 | 145 | 25 | 140 | 0.21 | 0.12 | 0.15 |
57200840 | 57200930 | 90 | 4 | 12 | 16 | 11 | 102 | 113 | 15 | 114 | 0.16 | 0.12 | 0.12 |
57200842 | 57200856 | 14 | 27 | 130 | 157 | 127 | 802 | 929 | 154 | 932 | 0.04 | 0.14 | 0.14 |
57200842 | 57200869 | 27 | 6 | 62 | 68 | 48 | 324 | 372 | 54 | 386 | -0.04 | 0.15 | 0.12 |
57200842 | 57200876 | 34 | 5 | 21 | 26 | 16 | 101 | 117 | 21 | 122 | 0.06 | 0.18 | 0.15 |
57200842 | 57200893 | 51 | 2 | 8 | 10 | 21 | 54 | 75 | 23 | 62 | -0.06 | 0.12 | 0.27 |
57200842 | 57200910 | 68 | 4 | 20 | 24 | 22 | 123 | 145 | 26 | 143 | 0.01 | 0.14 | 0.15 |
57200842 | 57200930 | 88 | 5 | 22 | 27 | 10 | 106 | 116 | 15 | 128 | 0.13 | 0.19 | 0.10 |
57200842 | 57200954 | 112 | 3 | 3 | 6 | 6 | 21 | 27 | 9 | 24 | 0.24 | 0.18 | 0.27 |
57200856 | 57200869 | 13 | 16 | 82 | 98 | 73 | 544 | 617 | 89 | 626 | 0.05 | 0.14 | 0.12 |
57200856 | 57200876 | 20 | 8 | 49 | 57 | 51 | 311 | 362 | 59 | 360 | -0.00 | 0.14 | 0.14 |
57200856 | 57200893 | 37 | 5 | 10 | 15 | 24 | 78 | 102 | 29 | 88 | 0.08 | 0.13 | 0.25 |
57200856 | 57200910 | 54 | 3 | 17 | 20 | 20 | 122 | 142 | 23 | 139 | 0.01 | 0.12 | 0.14 |
57200856 | 57200930 | 74 | 2 | 25 | 27 | 18 | 139 | 157 | 20 | 164 | -0.05 | 0.15 | 0.11 |
57200856 | 57200954 | 98 | 6 | 6 | 12 | 28 | 45 | 73 | 34 | 51 | 0.08 | 0.14 | 0.40 |
57200869 | 57200876 | 7 | 28 | 56 | 84 | 68 | 541 | 609 | 96 | 597 | 0.21 | 0.12 | 0.14 |
57200869 | 57200893 | 24 | 6 | 36 | 42 | 56 | 226 | 282 | 62 | 262 | -0.05 | 0.13 | 0.19 |
57200869 | 57200930 | 61 | 0 | 16 | 16 | 14 | 101 | 115 | 14 | 117 | -0.13 | 0.12 | 0.11 |
57200869 | 57200954 | 85 | 9 | 7 | 16 | 31 | 67 | 98 | 40 | 74 | 0.18 | 0.14 | 0.35 |
57200876 | 57200893 | 17 | 8 | 54 | 62 | 81 | 353 | 434 | 89 | 407 | -0.05 | 0.12 | 0.18 |
57200876 | 57200910 | 34 | 2 | 14 | 16 | 21 | 111 | 132 | 23 | 125 | -0.03 | 0.11 | 0.16 |
57200893 | 57200910 | 17 | 31 | 98 | 129 | 68 | 436 | 504 | 99 | 534 | 0.12 | 0.20 | 0.16 |
57200893 | 57200930 | 37 | 4 | 9 | 13 | 26 | 39 | 65 | 30 | 48 | -0.07 | 0.17 | 0.38 |
57200893 | 57200954 | 61 | 4 | 14 | 18 | 17 | 52 | 69 | 21 | 66 | -0.02 | 0.21 | 0.24 |
57200893 | 57200969 | 76 | 1 | 19 | 20 | 11 | 81 | 92 | 12 | 100 | -0.09 | 0.18 | 0.11 |
57200893 | 57200986 | 93 | 2 | 13 | 15 | 7 | 58 | 65 | 9 | 71 | 0.03 | 0.19 | 0.11 |
57200910 | 57200930 | 20 | 18 | 33 | 51 | 41 | 152 | 193 | 59 | 185 | 0.13 | 0.21 | 0.24 |
57200930 | 57200954 | 24 | 20 | 11 | 31 | 72 | 169 | 241 | 92 | 180 | 0.23 | 0.11 | 0.34 |
57200930 | 57200986 | 56 | 2 | 0 | 2 | 1 | 12 | 13 | 3 | 12 | 0.78 | 0.13 | 0.20 |
57200954 | 57200969 | 15 | 39 | 93 | 132 | 24 | 253 | 277 | 63 | 346 | 0.27 | 0.32 | 0.15 |
57200954 | 57200986 | 32 | 9 | 30 | 39 | 14 | 79 | 93 | 23 | 109 | 0.10 | 0.30 | 0.17 |
57200969 | 57200986 | 17 | 24 | 40 | 64 | 51 | 309 | 360 | 75 | 349 | 0.22 | 0.15 | 0.18 |