r2 Matrix (?)
CpG Pair 1 | CpG Pair 2 | Distance | TT Count | TC Count | T* Count | CT Count | CC Count | C* Count | *T Count | *C Count | R Value | mafA | mafB |
592450 | 592522 | 72 | 10 | 2 | 12 | 0 | 2 | 2 | 10 | 4 | 0.65 | 0.14 | 0.29 |
592450 | 592530 | 80 | 11 | 3 | 14 | 0 | 2 | 2 | 11 | 5 | 0.56 | 0.12 | 0.31 |
592450 | 592533 | 83 | 11 | 2 | 13 | 1 | 1 | 2 | 12 | 3 | 0.29 | 0.13 | 0.20 |
592456 | 592468 | 12 | 63 | 5 | 68 | 10 | 4 | 14 | 73 | 9 | 0.26 | 0.17 | 0.11 |
592456 | 592472 | 16 | 52 | 4 | 56 | 7 | 4 | 11 | 59 | 8 | 0.33 | 0.16 | 0.12 |
592456 | 592522 | 66 | 9 | 1 | 10 | 1 | 2 | 3 | 10 | 3 | 0.57 | 0.23 | 0.23 |
592456 | 592530 | 74 | 10 | 2 | 12 | 2 | 2 | 4 | 12 | 4 | 0.33 | 0.25 | 0.25 |
592456 | 592533 | 77 | 10 | 1 | 11 | 3 | 1 | 4 | 13 | 2 | 0.21 | 0.27 | 0.13 |
592468 | 592472 | 4 | 56 | 3 | 59 | 3 | 5 | 8 | 59 | 8 | 0.57 | 0.12 | 0.12 |
592488 | 592491 | 3 | 14 | 2 | 16 | 3 | 2 | 5 | 17 | 4 | 0.30 | 0.24 | 0.19 |
592488 | 592503 | 15 | 13 | 3 | 16 | 3 | 2 | 5 | 16 | 5 | 0.21 | 0.24 | 0.24 |
592488 | 592510 | 22 | 15 | 1 | 16 | 3 | 2 | 5 | 18 | 3 | 0.41 | 0.24 | 0.14 |
592488 | 592512 | 24 | 15 | 1 | 16 | 2 | 3 | 5 | 17 | 4 | 0.58 | 0.24 | 0.19 |
592488 | 592518 | 30 | 15 | 1 | 16 | 3 | 2 | 5 | 18 | 3 | 0.41 | 0.24 | 0.14 |
592488 | 592522 | 34 | 13 | 2 | 15 | 1 | 3 | 4 | 14 | 5 | 0.57 | 0.21 | 0.26 |
592491 | 592503 | 12 | 55 | 10 | 65 | 10 | 3 | 13 | 65 | 13 | 0.08 | 0.17 | 0.17 |
592491 | 592510 | 19 | 59 | 6 | 65 | 12 | 3 | 15 | 71 | 9 | 0.13 | 0.19 | 0.11 |
592491 | 592512 | 21 | 59 | 6 | 65 | 9 | 6 | 15 | 68 | 12 | 0.34 | 0.19 | 0.15 |
592491 | 592518 | 27 | 59 | 6 | 65 | 11 | 4 | 15 | 70 | 10 | 0.21 | 0.19 | 0.12 |
592491 | 592522 | 31 | 58 | 6 | 64 | 8 | 6 | 14 | 66 | 12 | 0.36 | 0.18 | 0.15 |
592503 | 592512 | 9 | 209 | 23 | 232 | 33 | 12 | 45 | 242 | 35 | 0.19 | 0.16 | 0.13 |
592503 | 592518 | 15 | 202 | 30 | 232 | 34 | 11 | 45 | 236 | 41 | 0.12 | 0.16 | 0.15 |
592503 | 592522 | 19 | 201 | 29 | 230 | 25 | 20 | 45 | 226 | 49 | 0.31 | 0.16 | 0.18 |
592503 | 592530 | 27 | 105 | 10 | 115 | 19 | 6 | 25 | 124 | 16 | 0.18 | 0.18 | 0.11 |
592503 | 592533 | 30 | 60 | 9 | 69 | 7 | 3 | 10 | 67 | 12 | 0.16 | 0.13 | 0.15 |
592503 | 592587 | 84 | 11 | 2 | 13 | 1 | 2 | 3 | 12 | 4 | 0.46 | 0.19 | 0.25 |
592510 | 592512 | 2 | 297 | 42 | 339 | 27 | 13 | 40 | 324 | 55 | 0.17 | 0.11 | 0.15 |
592510 | 592518 | 8 | 295 | 44 | 339 | 26 | 14 | 40 | 321 | 58 | 0.19 | 0.11 | 0.15 |
592510 | 592522 | 12 | 293 | 45 | 338 | 23 | 17 | 40 | 316 | 62 | 0.24 | 0.11 | 0.16 |
592510 | 592530 | 20 | 189 | 23 | 212 | 17 | 12 | 29 | 206 | 35 | 0.28 | 0.12 | 0.15 |
592510 | 592533 | 23 | 140 | 15 | 155 | 14 | 10 | 24 | 154 | 25 | 0.31 | 0.13 | 0.14 |
592510 | 592540 | 30 | 63 | 8 | 71 | 10 | 4 | 14 | 73 | 12 | 0.18 | 0.16 | 0.14 |
592510 | 592587 | 77 | 11 | 5 | 16 | 2 | 0 | 2 | 13 | 5 | -0.22 | 0.11 | 0.28 |
592512 | 592518 | 6 | 309 | 35 | 344 | 33 | 25 | 58 | 342 | 60 | 0.33 | 0.14 | 0.15 |
592512 | 592522 | 10 | 302 | 42 | 344 | 32 | 25 | 57 | 334 | 67 | 0.30 | 0.14 | 0.17 |
592512 | 592530 | 18 | 199 | 24 | 223 | 25 | 16 | 41 | 224 | 40 | 0.28 | 0.16 | 0.15 |
592512 | 592533 | 21 | 152 | 15 | 167 | 22 | 12 | 34 | 174 | 27 | 0.29 | 0.17 | 0.13 |
592512 | 592540 | 28 | 80 | 11 | 91 | 12 | 5 | 17 | 92 | 16 | 0.18 | 0.16 | 0.15 |
592512 | 592544 | 32 | 46 | 3 | 49 | 6 | 5 | 11 | 52 | 8 | 0.45 | 0.18 | 0.13 |
592512 | 592587 | 75 | 11 | 5 | 16 | 2 | 0 | 2 | 13 | 5 | -0.22 | 0.11 | 0.28 |
592518 | 592522 | 4 | 351 | 46 | 397 | 38 | 28 | 66 | 389 | 74 | 0.29 | 0.14 | 0.16 |
592518 | 592530 | 12 | 253 | 27 | 280 | 23 | 22 | 45 | 276 | 49 | 0.38 | 0.14 | 0.15 |
592518 | 592533 | 15 | 209 | 19 | 228 | 21 | 14 | 35 | 230 | 33 | 0.33 | 0.13 | 0.13 |
592518 | 592540 | 22 | 129 | 22 | 151 | 13 | 7 | 20 | 142 | 29 | 0.17 | 0.12 | 0.17 |
592518 | 592544 | 26 | 99 | 8 | 107 | 7 | 8 | 15 | 106 | 16 | 0.45 | 0.12 | 0.13 |
592518 | 592587 | 69 | 11 | 4 | 15 | 2 | 1 | 3 | 13 | 5 | 0.06 | 0.17 | 0.28 |
592522 | 592530 | 8 | 305 | 32 | 337 | 34 | 32 | 66 | 339 | 64 | 0.40 | 0.16 | 0.16 |
592522 | 592533 | 11 | 260 | 29 | 289 | 35 | 17 | 52 | 295 | 46 | 0.24 | 0.15 | 0.13 |
592522 | 592540 | 18 | 181 | 30 | 211 | 21 | 16 | 37 | 202 | 46 | 0.27 | 0.15 | 0.19 |
592522 | 592544 | 22 | 151 | 15 | 166 | 24 | 9 | 33 | 175 | 24 | 0.21 | 0.17 | 0.12 |
592530 | 592533 | 3 | 363 | 38 | 401 | 46 | 24 | 70 | 409 | 62 | 0.26 | 0.15 | 0.13 |
592530 | 592540 | 10 | 273 | 45 | 318 | 38 | 20 | 58 | 311 | 65 | 0.19 | 0.15 | 0.17 |
592530 | 592544 | 14 | 259 | 21 | 280 | 36 | 13 | 49 | 295 | 34 | 0.22 | 0.15 | 0.10 |
592533 | 592540 | 7 | 303 | 55 | 358 | 34 | 19 | 53 | 337 | 74 | 0.18 | 0.13 | 0.18 |
592533 | 592544 | 11 | 291 | 25 | 316 | 34 | 14 | 48 | 325 | 39 | 0.23 | 0.13 | 0.11 |
592540 | 592544 | 4 | 361 | 30 | 391 | 71 | 26 | 97 | 432 | 56 | 0.24 | 0.20 | 0.11 |
592540 | 592573 | 33 | 42 | 5 | 47 | 9 | 2 | 11 | 51 | 7 | 0.09 | 0.19 | 0.12 |
592544 | 592571 | 27 | 151 | 12 | 163 | 16 | 7 | 23 | 167 | 19 | 0.25 | 0.12 | 0.10 |
592571 | 592573 | 2 | 509 | 47 | 556 | 43 | 30 | 73 | 552 | 77 | 0.32 | 0.12 | 0.12 |
592571 | 592587 | 16 | 211 | 28 | 239 | 18 | 22 | 40 | 229 | 50 | 0.40 | 0.14 | 0.18 |
592573 | 592587 | 14 | 227 | 19 | 246 | 16 | 34 | 50 | 243 | 53 | 0.59 | 0.17 | 0.18 |