r2 Matrix (?)
CpG Pair 1 | CpG Pair 2 | Distance | TT Count | TC Count | T* Count | CT Count | CC Count | C* Count | *T Count | *C Count | R Value | mafA | mafB |
60072180 | 60072209 | 29 | 31 | 16 | 47 | 58 | 84 | 142 | 89 | 100 | 0.22 | 0.25 | 0.47 |
60072180 | 60072233 | 53 | 5 | 2 | 7 | 2 | 10 | 12 | 7 | 12 | 0.55 | 0.37 | 0.37 |
60072180 | 60072253 | 73 | 15 | 18 | 33 | 4 | 50 | 54 | 19 | 68 | 0.45 | 0.38 | 0.22 |
60072180 | 60072255 | 75 | 14 | 20 | 34 | 9 | 49 | 58 | 23 | 69 | 0.29 | 0.37 | 0.25 |
60072180 | 60072258 | 78 | 18 | 17 | 35 | 4 | 67 | 71 | 22 | 84 | 0.53 | 0.33 | 0.21 |
60072180 | 60072270 | 90 | 15 | 21 | 36 | 9 | 63 | 72 | 24 | 84 | 0.33 | 0.33 | 0.22 |
60072209 | 60072233 | 24 | 84 | 67 | 151 | 44 | 136 | 180 | 128 | 203 | 0.32 | 0.46 | 0.39 |
60072209 | 60072253 | 44 | 2 | 3 | 5 | 0 | 10 | 10 | 2 | 13 | 0.56 | 0.33 | 0.13 |
60072209 | 60072255 | 46 | 2 | 5 | 7 | 3 | 9 | 12 | 5 | 14 | 0.04 | 0.37 | 0.26 |
60072209 | 60072258 | 49 | 5 | 15 | 20 | 1 | 17 | 18 | 6 | 32 | 0.27 | 0.47 | 0.16 |
60072209 | 60072270 | 61 | 10 | 28 | 38 | 4 | 29 | 33 | 14 | 57 | 0.18 | 0.46 | 0.20 |
60072233 | 60072253 | 20 | 68 | 87 | 155 | 53 | 233 | 286 | 121 | 320 | 0.27 | 0.35 | 0.27 |
60072233 | 60072255 | 22 | 65 | 72 | 137 | 44 | 199 | 243 | 109 | 271 | 0.31 | 0.36 | 0.29 |
60072233 | 60072258 | 25 | 34 | 73 | 107 | 40 | 130 | 170 | 74 | 203 | 0.09 | 0.39 | 0.27 |
60072253 | 60072255 | 2 | 160 | 129 | 289 | 155 | 590 | 745 | 315 | 719 | 0.34 | 0.28 | 0.30 |
60072253 | 60072258 | 5 | 110 | 153 | 263 | 136 | 532 | 668 | 246 | 685 | 0.22 | 0.28 | 0.26 |
60072253 | 60072270 | 17 | 98 | 80 | 178 | 97 | 342 | 439 | 195 | 422 | 0.32 | 0.29 | 0.32 |
60072253 | 60072279 | 26 | 23 | 78 | 101 | 14 | 230 | 244 | 37 | 308 | 0.25 | 0.29 | 0.11 |
60072255 | 60072258 | 3 | 120 | 193 | 313 | 142 | 544 | 686 | 262 | 737 | 0.19 | 0.31 | 0.26 |
60072255 | 60072270 | 15 | 112 | 107 | 219 | 97 | 368 | 465 | 209 | 475 | 0.31 | 0.32 | 0.31 |
60072255 | 60072279 | 24 | 28 | 101 | 129 | 16 | 264 | 280 | 44 | 365 | 0.24 | 0.32 | 0.11 |
60072255 | 60072341 | 86 | 1 | 7 | 8 | 3 | 21 | 24 | 4 | 28 | 0.00 | 0.25 | 0.12 |
60072255 | 60072359 | 104 | 1 | 4 | 5 | 6 | 13 | 19 | 7 | 17 | -0.10 | 0.21 | 0.29 |
60072255 | 60072362 | 107 | 2 | 2 | 4 | 1 | 13 | 14 | 3 | 15 | 0.48 | 0.22 | 0.17 |
60072255 | 60072364 | 109 | 1 | 2 | 3 | 4 | 9 | 13 | 5 | 11 | 0.02 | 0.19 | 0.31 |
60072258 | 60072270 | 12 | 135 | 74 | 209 | 113 | 537 | 650 | 248 | 611 | 0.45 | 0.24 | 0.29 |
60072258 | 60072341 | 83 | 2 | 12 | 14 | 2 | 17 | 19 | 4 | 29 | 0.06 | 0.42 | 0.12 |
60072258 | 60072359 | 101 | 5 | 6 | 11 | 3 | 12 | 15 | 8 | 18 | 0.27 | 0.42 | 0.31 |
60072258 | 60072362 | 104 | 4 | 3 | 7 | 0 | 13 | 13 | 4 | 16 | 0.68 | 0.35 | 0.20 |
60072258 | 60072364 | 106 | 4 | 3 | 7 | 2 | 9 | 11 | 6 | 12 | 0.40 | 0.39 | 0.33 |
60072270 | 60072279 | 9 | 69 | 194 | 263 | 28 | 616 | 644 | 97 | 810 | 0.32 | 0.29 | 0.11 |
60072270 | 60072341 | 71 | 2 | 7 | 9 | 3 | 23 | 26 | 5 | 30 | 0.13 | 0.26 | 0.14 |
60072270 | 60072359 | 89 | 5 | 3 | 8 | 6 | 19 | 25 | 11 | 22 | 0.35 | 0.24 | 0.33 |
60072270 | 60072362 | 92 | 6 | 1 | 7 | 1 | 19 | 20 | 7 | 20 | 0.81 | 0.26 | 0.26 |
60072270 | 60072364 | 94 | 4 | 3 | 7 | 4 | 15 | 19 | 8 | 18 | 0.35 | 0.27 | 0.31 |
60072270 | 60072370 | 100 | 2 | 3 | 5 | 1 | 12 | 13 | 3 | 15 | 0.39 | 0.28 | 0.17 |
60072279 | 60072341 | 62 | 2 | 3 | 5 | 3 | 19 | 22 | 5 | 22 | 0.26 | 0.19 | 0.19 |
60072279 | 60072359 | 80 | 3 | 2 | 5 | 9 | 15 | 24 | 12 | 17 | 0.17 | 0.17 | 0.41 |
60072279 | 60072362 | 83 | 3 | 1 | 4 | 6 | 15 | 21 | 9 | 16 | 0.35 | 0.16 | 0.36 |
60072279 | 60072364 | 85 | 2 | 2 | 4 | 8 | 13 | 21 | 10 | 15 | 0.09 | 0.16 | 0.40 |
60072279 | 60072370 | 91 | 3 | 1 | 4 | 1 | 15 | 16 | 4 | 16 | 0.69 | 0.20 | 0.20 |
60072341 | 60072359 | 18 | 20 | 12 | 32 | 43 | 147 | 190 | 63 | 159 | 0.31 | 0.14 | 0.28 |
60072341 | 60072362 | 21 | 16 | 9 | 25 | 30 | 115 | 145 | 46 | 124 | 0.34 | 0.15 | 0.27 |
60072341 | 60072364 | 23 | 14 | 8 | 22 | 33 | 96 | 129 | 47 | 104 | 0.29 | 0.15 | 0.31 |
60072341 | 60072370 | 29 | 12 | 7 | 19 | 16 | 59 | 75 | 28 | 66 | 0.37 | 0.20 | 0.30 |
60072359 | 60072362 | 3 | 40 | 40 | 80 | 34 | 129 | 163 | 74 | 169 | 0.30 | 0.33 | 0.30 |
60072359 | 60072364 | 5 | 44 | 30 | 74 | 36 | 115 | 151 | 80 | 145 | 0.35 | 0.33 | 0.36 |
60072359 | 60072370 | 11 | 32 | 28 | 60 | 18 | 91 | 109 | 50 | 119 | 0.39 | 0.36 | 0.30 |
60072362 | 60072364 | 2 | 49 | 22 | 71 | 35 | 131 | 166 | 84 | 153 | 0.46 | 0.30 | 0.35 |
60072362 | 60072370 | 8 | 34 | 24 | 58 | 19 | 103 | 122 | 53 | 127 | 0.44 | 0.32 | 0.29 |
60072364 | 60072370 | 6 | 44 | 31 | 75 | 10 | 99 | 109 | 54 | 130 | 0.53 | 0.41 | 0.29 |