r2 Matrix (?)
CpG Pair 1 | CpG Pair 2 | Distance | TT Count | TC Count | T* Count | CT Count | CC Count | C* Count | *T Count | *C Count | R Value | mafA | mafB |
57200212 | 57200258 | 46 | 2 | 0 | 2 | 1 | 13 | 14 | 3 | 13 | 0.79 | 0.12 | 0.19 |
57200222 | 57200282 | 60 | 0 | 2 | 2 | 3 | 12 | 15 | 3 | 14 | -0.17 | 0.12 | 0.18 |
57200222 | 57200291 | 69 | 1 | 1 | 2 | 4 | 11 | 15 | 5 | 12 | 0.17 | 0.12 | 0.29 |
57200258 | 57200282 | 24 | 3 | 2 | 5 | 4 | 36 | 40 | 7 | 38 | 0.43 | 0.11 | 0.16 |
57200258 | 57200344 | 86 | 1 | 2 | 3 | 1 | 12 | 13 | 2 | 14 | 0.30 | 0.19 | 0.12 |
57200282 | 57200291 | 9 | 7 | 1 | 8 | 7 | 52 | 59 | 14 | 53 | 0.60 | 0.12 | 0.21 |
57200344 | 57200364 | 20 | 0 | 4 | 4 | 3 | 13 | 16 | 3 | 17 | -0.21 | 0.20 | 0.15 |
57200364 | 57200386 | 22 | 3 | 1 | 4 | 2 | 29 | 31 | 5 | 30 | 0.62 | 0.11 | 0.14 |
57200386 | 57200393 | 7 | 5 | 3 | 8 | 1 | 43 | 44 | 6 | 46 | 0.68 | 0.15 | 0.12 |
57200386 | 57200428 | 42 | 1 | 1 | 2 | 1 | 8 | 9 | 2 | 9 | 0.39 | 0.18 | 0.18 |
57200386 | 57200431 | 45 | 2 | 1 | 3 | 1 | 11 | 12 | 3 | 12 | 0.58 | 0.20 | 0.20 |
57200393 | 57200431 | 38 | 2 | 0 | 2 | 1 | 9 | 10 | 3 | 9 | 0.78 | 0.17 | 0.25 |
57200404 | 57200418 | 14 | 1 | 3 | 4 | 3 | 31 | 34 | 4 | 34 | 0.16 | 0.11 | 0.11 |
57200404 | 57200431 | 27 | 0 | 2 | 2 | 3 | 8 | 11 | 3 | 10 | -0.23 | 0.15 | 0.23 |
57200408 | 57200418 | 10 | 1 | 4 | 5 | 4 | 36 | 40 | 5 | 40 | 0.10 | 0.11 | 0.11 |
57200408 | 57200431 | 23 | 2 | 1 | 3 | 1 | 15 | 16 | 3 | 16 | 0.60 | 0.16 | 0.16 |
57200418 | 57200431 | 13 | 1 | 2 | 3 | 3 | 22 | 25 | 4 | 24 | 0.19 | 0.11 | 0.14 |
57200428 | 57200431 | 3 | 6 | 2 | 8 | 6 | 37 | 43 | 12 | 39 | 0.52 | 0.16 | 0.24 |
57200465 | 57200472 | 7 | 7 | 10 | 17 | 11 | 67 | 78 | 18 | 77 | 0.27 | 0.18 | 0.19 |
57200465 | 57200478 | 13 | 6 | 11 | 17 | 5 | 56 | 61 | 11 | 67 | 0.32 | 0.22 | 0.14 |
57200465 | 57200495 | 30 | 1 | 5 | 6 | 2 | 17 | 19 | 3 | 22 | 0.08 | 0.24 | 0.12 |
57200465 | 57200514 | 49 | 0 | 2 | 2 | 2 | 11 | 13 | 2 | 13 | -0.15 | 0.13 | 0.13 |
57200472 | 57200478 | 6 | 7 | 11 | 18 | 8 | 65 | 73 | 15 | 76 | 0.30 | 0.20 | 0.16 |
57200478 | 57200495 | 17 | 3 | 7 | 10 | 3 | 33 | 36 | 6 | 40 | 0.27 | 0.22 | 0.13 |
57200478 | 57200500 | 22 | 3 | 4 | 7 | 1 | 18 | 19 | 4 | 22 | 0.46 | 0.27 | 0.15 |
57200478 | 57200514 | 36 | 0 | 2 | 2 | 2 | 10 | 12 | 2 | 12 | -0.17 | 0.14 | 0.14 |
57200512 | 57200514 | 2 | 8 | 3 | 11 | 1 | 67 | 68 | 9 | 70 | 0.78 | 0.14 | 0.11 |