r2 Matrix (?)
CpG Pair 1 | CpG Pair 2 | Distance | TT Count | TC Count | T* Count | CT Count | CC Count | C* Count | *T Count | *C Count | R Value | mafA | mafB |
3680539 | 3680542 | 3 | 99 | 30 | 129 | 45 | 634 | 679 | 144 | 664 | 0.67 | 0.16 | 0.18 |
3680539 | 3680544 | 5 | 84 | 36 | 120 | 57 | 535 | 592 | 141 | 571 | 0.57 | 0.17 | 0.20 |
3680539 | 3680549 | 10 | 66 | 34 | 100 | 40 | 454 | 494 | 106 | 488 | 0.57 | 0.17 | 0.18 |
3680539 | 3680556 | 17 | 37 | 34 | 71 | 103 | 231 | 334 | 140 | 265 | 0.17 | 0.18 | 0.35 |
3680539 | 3680559 | 20 | 26 | 35 | 61 | 23 | 241 | 264 | 49 | 276 | 0.37 | 0.19 | 0.15 |
3680539 | 3680561 | 22 | 25 | 21 | 46 | 11 | 179 | 190 | 36 | 200 | 0.54 | 0.19 | 0.15 |
3680542 | 3680544 | 2 | 96 | 47 | 143 | 60 | 575 | 635 | 156 | 622 | 0.56 | 0.18 | 0.20 |
3680542 | 3680549 | 7 | 73 | 49 | 122 | 46 | 489 | 535 | 119 | 538 | 0.52 | 0.19 | 0.18 |
3680542 | 3680556 | 14 | 47 | 38 | 85 | 116 | 268 | 384 | 163 | 306 | 0.20 | 0.18 | 0.35 |
3680542 | 3680559 | 17 | 38 | 33 | 71 | 24 | 292 | 316 | 62 | 325 | 0.48 | 0.18 | 0.16 |
3680542 | 3680561 | 19 | 33 | 23 | 56 | 15 | 229 | 244 | 48 | 252 | 0.56 | 0.19 | 0.16 |
3680544 | 3680549 | 5 | 71 | 67 | 138 | 55 | 487 | 542 | 126 | 554 | 0.43 | 0.20 | 0.19 |
3680544 | 3680556 | 12 | 54 | 45 | 99 | 118 | 275 | 393 | 172 | 320 | 0.21 | 0.20 | 0.35 |
3680544 | 3680559 | 15 | 42 | 45 | 87 | 24 | 300 | 324 | 66 | 345 | 0.46 | 0.21 | 0.16 |
3680544 | 3680561 | 17 | 38 | 30 | 68 | 13 | 240 | 253 | 51 | 270 | 0.57 | 0.21 | 0.16 |
3680549 | 3680556 | 7 | 64 | 57 | 121 | 139 | 293 | 432 | 203 | 350 | 0.18 | 0.22 | 0.37 |
3680549 | 3680559 | 10 | 42 | 65 | 107 | 38 | 326 | 364 | 80 | 391 | 0.32 | 0.23 | 0.17 |
3680549 | 3680561 | 12 | 42 | 50 | 92 | 21 | 273 | 294 | 63 | 323 | 0.44 | 0.24 | 0.16 |
3680556 | 3680559 | 3 | 54 | 158 | 212 | 42 | 302 | 344 | 96 | 460 | 0.17 | 0.38 | 0.17 |
3680556 | 3680561 | 5 | 48 | 135 | 183 | 35 | 248 | 283 | 83 | 383 | 0.18 | 0.39 | 0.18 |
3680559 | 3680561 | 2 | 49 | 46 | 95 | 40 | 363 | 403 | 89 | 409 | 0.43 | 0.19 | 0.18 |