r2 Matrix (?)
CpG Pair 1 | CpG Pair 2 | Distance | TT Count | TC Count | T* Count | CT Count | CC Count | C* Count | *T Count | *C Count | R Value | mafA | mafB |
6626295 | 6626301 | 6 | 94 | 15 | 109 | 23 | 114 | 137 | 117 | 129 | 0.69 | 0.44 | 0.48 |
6626295 | 6626349 | 54 | 17 | 0 | 17 | 4 | 17 | 21 | 21 | 17 | 0.81 | 0.45 | 0.45 |
6626295 | 6626353 | 58 | 20 | 4 | 24 | 7 | 24 | 31 | 27 | 28 | 0.60 | 0.44 | 0.49 |
6626295 | 6626359 | 64 | 24 | 6 | 30 | 7 | 40 | 47 | 31 | 46 | 0.65 | 0.39 | 0.40 |
6626295 | 6626413 | 118 | 10 | 1 | 11 | 14 | 3 | 17 | 24 | 4 | 0.12 | 0.39 | 0.14 |
6626301 | 6626349 | 48 | 15 | 1 | 16 | 0 | 10 | 10 | 15 | 11 | 0.92 | 0.38 | 0.42 |
6626301 | 6626353 | 52 | 20 | 3 | 23 | 0 | 14 | 14 | 20 | 17 | 0.85 | 0.38 | 0.46 |
6626301 | 6626359 | 58 | 23 | 4 | 27 | 1 | 24 | 25 | 24 | 28 | 0.81 | 0.48 | 0.46 |
6626301 | 6626413 | 112 | 21 | 4 | 25 | 27 | 3 | 30 | 48 | 7 | -0.09 | 0.45 | 0.13 |
6626349 | 6626353 | 4 | 281 | 50 | 331 | 59 | 564 | 623 | 340 | 614 | 0.75 | 0.35 | 0.36 |
6626349 | 6626359 | 10 | 252 | 48 | 300 | 60 | 503 | 563 | 312 | 551 | 0.73 | 0.35 | 0.36 |
6626349 | 6626413 | 64 | 88 | 3 | 91 | 135 | 38 | 173 | 223 | 41 | 0.24 | 0.34 | 0.16 |
6626349 | 6626443 | 94 | 175 | 7 | 182 | 109 | 258 | 367 | 284 | 265 | 0.63 | 0.33 | 0.48 |
6626349 | 6626448 | 99 | 153 | 9 | 162 | 201 | 110 | 311 | 354 | 119 | 0.33 | 0.34 | 0.25 |
6626349 | 6626452 | 103 | 130 | 7 | 137 | 80 | 198 | 278 | 210 | 205 | 0.62 | 0.33 | 0.49 |
6626349 | 6626456 | 107 | 104 | 4 | 108 | 114 | 94 | 208 | 218 | 98 | 0.42 | 0.34 | 0.31 |
6626349 | 6626472 | 123 | 13 | 2 | 15 | 19 | 21 | 40 | 32 | 23 | 0.35 | 0.27 | 0.42 |
6626353 | 6626359 | 6 | 287 | 71 | 358 | 77 | 560 | 637 | 364 | 631 | 0.68 | 0.36 | 0.37 |
6626353 | 6626413 | 60 | 68 | 2 | 70 | 124 | 29 | 153 | 192 | 31 | 0.22 | 0.31 | 0.14 |
6626353 | 6626443 | 90 | 184 | 22 | 206 | 125 | 262 | 387 | 309 | 284 | 0.54 | 0.35 | 0.48 |
6626353 | 6626448 | 95 | 164 | 25 | 189 | 235 | 103 | 338 | 399 | 128 | 0.19 | 0.36 | 0.24 |
6626353 | 6626452 | 99 | 152 | 13 | 165 | 94 | 217 | 311 | 246 | 230 | 0.59 | 0.35 | 0.48 |
6626353 | 6626456 | 103 | 122 | 15 | 137 | 145 | 92 | 237 | 267 | 107 | 0.30 | 0.37 | 0.29 |
6626353 | 6626472 | 119 | 19 | 5 | 24 | 23 | 20 | 43 | 42 | 25 | 0.26 | 0.36 | 0.37 |
6626359 | 6626413 | 54 | 53 | 2 | 55 | 112 | 23 | 135 | 165 | 25 | 0.18 | 0.29 | 0.13 |
6626359 | 6626443 | 84 | 218 | 16 | 234 | 107 | 280 | 387 | 325 | 296 | 0.64 | 0.38 | 0.48 |
6626359 | 6626448 | 89 | 200 | 21 | 221 | 229 | 119 | 348 | 429 | 140 | 0.28 | 0.39 | 0.25 |
6626359 | 6626452 | 93 | 193 | 9 | 202 | 86 | 245 | 331 | 279 | 254 | 0.68 | 0.38 | 0.48 |
6626359 | 6626456 | 97 | 150 | 20 | 170 | 158 | 106 | 264 | 308 | 126 | 0.30 | 0.39 | 0.29 |
6626359 | 6626472 | 113 | 22 | 9 | 31 | 35 | 27 | 62 | 57 | 36 | 0.14 | 0.33 | 0.39 |
6626413 | 6626443 | 30 | 77 | 67 | 144 | 0 | 27 | 27 | 77 | 94 | 0.39 | 0.16 | 0.45 |
6626413 | 6626448 | 35 | 26 | 12 | 38 | 1 | 10 | 11 | 27 | 22 | 0.50 | 0.22 | 0.45 |
6626413 | 6626452 | 39 | 25 | 16 | 41 | 0 | 5 | 5 | 25 | 21 | 0.38 | 0.11 | 0.46 |
6626413 | 6626456 | 43 | 34 | 11 | 45 | 1 | 5 | 6 | 35 | 16 | 0.41 | 0.12 | 0.31 |
6626413 | 6626472 | 59 | 48 | 14 | 62 | 8 | 3 | 11 | 56 | 17 | 0.04 | 0.15 | 0.23 |
6626443 | 6626448 | 5 | 482 | 50 | 532 | 248 | 190 | 438 | 730 | 240 | 0.39 | 0.45 | 0.25 |
6626443 | 6626452 | 9 | 361 | 104 | 465 | 83 | 310 | 393 | 444 | 414 | 0.56 | 0.46 | 0.48 |
6626443 | 6626456 | 13 | 343 | 43 | 386 | 156 | 156 | 312 | 499 | 199 | 0.43 | 0.45 | 0.29 |
6626443 | 6626472 | 29 | 60 | 23 | 83 | 30 | 32 | 62 | 90 | 55 | 0.24 | 0.43 | 0.38 |
6626443 | 6626486 | 43 | 4 | 4 | 8 | 1 | 4 | 5 | 5 | 8 | 0.30 | 0.38 | 0.38 |
6626443 | 6626491 | 48 | 3 | 6 | 9 | 1 | 5 | 6 | 4 | 11 | 0.18 | 0.40 | 0.27 |
6626448 | 6626452 | 4 | 404 | 283 | 687 | 70 | 156 | 226 | 474 | 439 | 0.24 | 0.25 | 0.48 |
6626448 | 6626456 | 8 | 471 | 98 | 569 | 64 | 120 | 184 | 535 | 218 | 0.46 | 0.24 | 0.29 |
6626448 | 6626472 | 24 | 104 | 40 | 144 | 31 | 26 | 57 | 135 | 66 | 0.17 | 0.28 | 0.33 |
6626448 | 6626491 | 43 | 2 | 6 | 8 | 1 | 3 | 4 | 3 | 9 | 0.00 | 0.33 | 0.25 |
6626452 | 6626456 | 4 | 379 | 87 | 466 | 218 | 165 | 383 | 597 | 252 | 0.27 | 0.45 | 0.30 |
6626452 | 6626472 | 20 | 123 | 42 | 165 | 86 | 43 | 129 | 209 | 85 | 0.09 | 0.44 | 0.29 |
6626452 | 6626486 | 34 | 5 | 1 | 6 | 0 | 16 | 16 | 5 | 17 | 0.89 | 0.27 | 0.23 |
6626456 | 6626472 | 16 | 162 | 48 | 210 | 60 | 41 | 101 | 222 | 89 | 0.18 | 0.32 | 0.29 |
6626456 | 6626486 | 30 | 10 | 13 | 23 | 3 | 12 | 15 | 13 | 25 | 0.24 | 0.39 | 0.34 |
6626472 | 6626486 | 14 | 47 | 41 | 88 | 1 | 27 | 28 | 48 | 68 | 0.43 | 0.24 | 0.41 |
6626472 | 6626491 | 19 | 24 | 42 | 66 | 0 | 19 | 19 | 24 | 61 | 0.34 | 0.22 | 0.28 |
6626486 | 6626491 | 5 | 40 | 24 | 64 | 0 | 80 | 80 | 40 | 104 | 0.69 | 0.44 | 0.28 |