r2 Matrix (?)
CpG Pair 1 | CpG Pair 2 | Distance | TT Count | TC Count | T* Count | CT Count | CC Count | C* Count | *T Count | *C Count | R Value | mafA | mafB |
28173898 | 28173904 | 6 | 12 | 1 | 13 | 3 | 1 | 4 | 15 | 2 | 0.23 | 0.24 | 0.12 |
28173898 | 28173910 | 12 | 12 | 1 | 13 | 1 | 3 | 4 | 13 | 4 | 0.67 | 0.24 | 0.24 |
28173898 | 28173914 | 16 | 12 | 1 | 13 | 1 | 3 | 4 | 13 | 4 | 0.67 | 0.24 | 0.24 |
28173898 | 28173921 | 23 | 12 | 1 | 13 | 0 | 4 | 4 | 12 | 5 | 0.86 | 0.24 | 0.29 |
28173898 | 28173925 | 27 | 11 | 2 | 13 | 3 | 1 | 4 | 14 | 3 | 0.11 | 0.24 | 0.18 |
28173910 | 28173914 | 4 | 35 | 1 | 36 | 1 | 6 | 7 | 36 | 7 | 0.83 | 0.16 | 0.16 |
28173910 | 28173921 | 11 | 33 | 3 | 36 | 2 | 5 | 7 | 35 | 8 | 0.60 | 0.16 | 0.19 |
28173910 | 28173925 | 15 | 35 | 1 | 36 | 3 | 4 | 7 | 38 | 5 | 0.63 | 0.16 | 0.12 |
28173910 | 28173938 | 28 | 14 | 0 | 14 | 0 | 3 | 3 | 14 | 3 | 1.00 | 0.18 | 0.18 |
28173914 | 28173921 | 7 | 44 | 2 | 46 | 1 | 6 | 7 | 45 | 8 | 0.77 | 0.13 | 0.15 |
28173914 | 28173938 | 24 | 22 | 2 | 24 | 0 | 3 | 3 | 22 | 5 | 0.74 | 0.11 | 0.19 |
28173914 | 28173942 | 28 | 17 | 0 | 17 | 0 | 2 | 2 | 17 | 2 | 1.00 | 0.11 | 0.11 |
28173938 | 28173950 | 12 | 35 | 5 | 40 | 3 | 2 | 5 | 38 | 7 | 0.24 | 0.11 | 0.16 |
28173938 | 28173960 | 22 | 19 | 1 | 20 | 1 | 3 | 4 | 20 | 4 | 0.70 | 0.17 | 0.17 |
28173950 | 28173956 | 6 | 37 | 3 | 40 | 7 | 5 | 12 | 44 | 8 | 0.40 | 0.23 | 0.15 |
28173950 | 28173960 | 10 | 29 | 5 | 34 | 3 | 8 | 11 | 32 | 13 | 0.55 | 0.24 | 0.29 |
28173950 | 28173967 | 17 | 20 | 2 | 22 | 6 | 4 | 10 | 26 | 6 | 0.37 | 0.31 | 0.19 |
28173950 | 28173973 | 23 | 16 | 0 | 16 | 5 | 3 | 8 | 21 | 3 | 0.54 | 0.33 | 0.12 |
28173950 | 28173977 | 27 | 12 | 1 | 13 | 4 | 2 | 6 | 16 | 3 | 0.33 | 0.32 | 0.16 |
28173956 | 28173960 | 4 | 39 | 11 | 50 | 2 | 10 | 12 | 41 | 21 | 0.51 | 0.19 | 0.34 |
28173956 | 28173967 | 11 | 32 | 5 | 37 | 3 | 9 | 12 | 35 | 14 | 0.58 | 0.24 | 0.29 |
28173956 | 28173971 | 15 | 28 | 3 | 31 | 8 | 4 | 12 | 36 | 7 | 0.29 | 0.28 | 0.16 |
28173956 | 28173973 | 17 | 27 | 2 | 29 | 6 | 6 | 12 | 33 | 8 | 0.49 | 0.29 | 0.20 |
28173956 | 28173977 | 21 | 23 | 3 | 26 | 5 | 5 | 10 | 28 | 8 | 0.41 | 0.28 | 0.22 |
28173960 | 28173967 | 7 | 32 | 1 | 33 | 6 | 16 | 22 | 38 | 17 | 0.74 | 0.40 | 0.31 |
28173960 | 28173971 | 11 | 26 | 2 | 28 | 13 | 8 | 21 | 39 | 10 | 0.38 | 0.43 | 0.20 |
28173960 | 28173973 | 13 | 26 | 0 | 26 | 11 | 10 | 21 | 37 | 10 | 0.58 | 0.45 | 0.21 |
28173960 | 28173977 | 17 | 22 | 0 | 22 | 10 | 10 | 20 | 32 | 10 | 0.59 | 0.48 | 0.24 |
28173960 | 28173990 | 30 | 7 | 1 | 8 | 2 | 4 | 6 | 9 | 5 | 0.56 | 0.43 | 0.36 |
28173967 | 28173971 | 4 | 44 | 5 | 49 | 13 | 7 | 20 | 57 | 12 | 0.30 | 0.29 | 0.17 |
28173967 | 28173973 | 6 | 46 | 1 | 47 | 8 | 12 | 20 | 54 | 13 | 0.67 | 0.30 | 0.19 |
28173967 | 28173977 | 10 | 43 | 1 | 44 | 8 | 10 | 18 | 51 | 11 | 0.63 | 0.29 | 0.18 |
28173967 | 28173990 | 23 | 18 | 6 | 24 | 3 | 6 | 9 | 21 | 12 | 0.39 | 0.27 | 0.36 |
28173967 | 28173993 | 26 | 16 | 3 | 19 | 2 | 2 | 4 | 18 | 5 | 0.31 | 0.17 | 0.22 |
28173967 | 28173998 | 31 | 8 | 0 | 8 | 1 | 2 | 3 | 9 | 2 | 0.77 | 0.27 | 0.18 |
28173971 | 28173973 | 2 | 49 | 6 | 55 | 5 | 7 | 12 | 54 | 13 | 0.46 | 0.18 | 0.19 |
28173971 | 28173977 | 6 | 46 | 4 | 50 | 5 | 7 | 12 | 51 | 11 | 0.52 | 0.19 | 0.18 |
28173971 | 28173990 | 19 | 19 | 7 | 26 | 2 | 5 | 7 | 21 | 12 | 0.38 | 0.21 | 0.36 |
28173971 | 28173993 | 22 | 16 | 3 | 19 | 2 | 2 | 4 | 18 | 5 | 0.31 | 0.17 | 0.22 |
28173973 | 28173977 | 4 | 47 | 3 | 50 | 4 | 8 | 12 | 51 | 11 | 0.63 | 0.19 | 0.18 |
28173973 | 28173990 | 17 | 20 | 6 | 26 | 1 | 6 | 7 | 21 | 12 | 0.53 | 0.21 | 0.36 |
28173973 | 28173993 | 20 | 18 | 2 | 20 | 0 | 3 | 3 | 18 | 5 | 0.73 | 0.13 | 0.22 |
28173973 | 28173998 | 25 | 9 | 0 | 9 | 0 | 2 | 2 | 9 | 2 | 1.00 | 0.18 | 0.18 |
28173977 | 28173990 | 13 | 19 | 9 | 28 | 2 | 3 | 5 | 21 | 12 | 0.21 | 0.15 | 0.36 |
28173990 | 28173993 | 3 | 16 | 0 | 16 | 2 | 5 | 7 | 18 | 5 | 0.80 | 0.30 | 0.22 |
28173990 | 28173998 | 8 | 9 | 0 | 9 | 0 | 2 | 2 | 9 | 2 | 1.00 | 0.18 | 0.18 |