r2 Matrix (?)
CpG Pair 1 | CpG Pair 2 | Distance | TT Count | TC Count | T* Count | CT Count | CC Count | C* Count | *T Count | *C Count | R Value | mafA | mafB |
57200386 | 57200389 | 3 | 9 | 2 | 11 | 0 | 30 | 30 | 9 | 32 | 0.88 | 0.27 | 0.22 |
57200386 | 57200393 | 7 | 5 | 5 | 10 | 0 | 24 | 24 | 5 | 29 | 0.64 | 0.29 | 0.15 |
57200386 | 57200396 | 10 | 6 | 0 | 6 | 0 | 20 | 20 | 6 | 20 | 1.00 | 0.23 | 0.23 |
57200386 | 57200404 | 18 | 4 | 1 | 5 | 2 | 16 | 18 | 6 | 17 | 0.65 | 0.22 | 0.26 |
57200386 | 57200408 | 22 | 0 | 3 | 3 | 2 | 12 | 14 | 2 | 15 | -0.17 | 0.18 | 0.12 |
57200386 | 57200437 | 51 | 3 | 1 | 4 | 0 | 8 | 8 | 3 | 9 | 0.82 | 0.33 | 0.25 |
57200386 | 57200465 | 79 | 7 | 0 | 7 | 7 | 10 | 17 | 14 | 10 | 0.54 | 0.29 | 0.42 |
57200386 | 57200472 | 86 | 6 | 0 | 6 | 6 | 11 | 17 | 12 | 11 | 0.57 | 0.26 | 0.48 |
57200389 | 57200393 | 4 | 6 | 3 | 9 | 0 | 29 | 29 | 6 | 32 | 0.78 | 0.24 | 0.16 |
57200389 | 57200396 | 7 | 7 | 0 | 7 | 0 | 23 | 23 | 7 | 23 | 1.00 | 0.23 | 0.23 |
57200389 | 57200404 | 15 | 5 | 1 | 6 | 2 | 19 | 21 | 7 | 20 | 0.70 | 0.22 | 0.26 |
57200389 | 57200437 | 48 | 1 | 1 | 2 | 2 | 8 | 10 | 3 | 9 | 0.26 | 0.17 | 0.25 |
57200389 | 57200465 | 76 | 7 | 0 | 7 | 8 | 10 | 18 | 15 | 10 | 0.51 | 0.28 | 0.40 |
57200389 | 57200472 | 83 | 6 | 0 | 6 | 7 | 12 | 19 | 13 | 12 | 0.54 | 0.24 | 0.48 |
57200393 | 57200404 | 11 | 5 | 0 | 5 | 4 | 39 | 43 | 9 | 39 | 0.71 | 0.10 | 0.19 |
57200393 | 57200465 | 72 | 5 | 0 | 5 | 17 | 13 | 30 | 22 | 13 | 0.31 | 0.14 | 0.37 |
57200393 | 57200472 | 79 | 4 | 0 | 4 | 15 | 18 | 33 | 19 | 18 | 0.34 | 0.11 | 0.49 |
57200393 | 57200478 | 85 | 0 | 4 | 4 | 4 | 25 | 29 | 4 | 29 | -0.14 | 0.12 | 0.12 |
57200396 | 57200404 | 8 | 5 | 3 | 8 | 5 | 41 | 46 | 10 | 44 | 0.47 | 0.15 | 0.19 |
57200396 | 57200408 | 12 | 1 | 5 | 6 | 4 | 38 | 42 | 5 | 43 | 0.08 | 0.12 | 0.10 |
57200396 | 57200465 | 69 | 7 | 0 | 7 | 15 | 12 | 27 | 22 | 12 | 0.38 | 0.21 | 0.35 |
57200396 | 57200472 | 76 | 6 | 0 | 6 | 13 | 17 | 30 | 19 | 17 | 0.42 | 0.17 | 0.47 |
57200396 | 57200478 | 82 | 0 | 6 | 6 | 5 | 25 | 30 | 5 | 31 | -0.18 | 0.17 | 0.14 |
57200404 | 57200428 | 24 | 1 | 3 | 4 | 3 | 19 | 22 | 4 | 22 | 0.11 | 0.15 | 0.15 |
57200404 | 57200465 | 61 | 6 | 0 | 6 | 14 | 12 | 26 | 20 | 12 | 0.37 | 0.19 | 0.38 |
57200404 | 57200472 | 68 | 6 | 0 | 6 | 15 | 17 | 32 | 21 | 17 | 0.39 | 0.16 | 0.45 |
57200404 | 57200478 | 74 | 3 | 4 | 7 | 4 | 30 | 34 | 7 | 34 | 0.31 | 0.17 | 0.17 |
57200404 | 57200500 | 96 | 0 | 2 | 2 | 10 | 5 | 15 | 10 | 7 | -0.44 | 0.12 | 0.41 |
57200408 | 57200465 | 57 | 3 | 0 | 3 | 14 | 9 | 23 | 17 | 9 | 0.26 | 0.12 | 0.35 |
57200408 | 57200478 | 70 | 1 | 3 | 4 | 6 | 28 | 34 | 7 | 31 | 0.06 | 0.11 | 0.18 |
57200408 | 57200495 | 87 | 3 | 0 | 3 | 10 | 13 | 23 | 13 | 13 | 0.36 | 0.12 | 0.50 |
57200418 | 57200437 | 19 | 2 | 0 | 2 | 0 | 17 | 17 | 2 | 17 | 1.00 | 0.11 | 0.11 |
57200428 | 57200431 | 3 | 8 | 4 | 12 | 3 | 35 | 38 | 11 | 39 | 0.61 | 0.24 | 0.22 |
57200428 | 57200437 | 9 | 6 | 4 | 10 | 0 | 30 | 30 | 6 | 34 | 0.73 | 0.25 | 0.15 |
57200428 | 57200472 | 44 | 5 | 1 | 6 | 6 | 5 | 11 | 11 | 6 | 0.29 | 0.35 | 0.35 |
57200428 | 57200478 | 50 | 5 | 2 | 7 | 2 | 19 | 21 | 7 | 21 | 0.62 | 0.25 | 0.25 |
57200428 | 57200495 | 67 | 7 | 1 | 8 | 11 | 16 | 27 | 18 | 17 | 0.39 | 0.23 | 0.49 |
57200428 | 57200500 | 72 | 4 | 3 | 7 | 12 | 14 | 26 | 16 | 17 | 0.09 | 0.21 | 0.48 |
57200428 | 57200514 | 86 | 1 | 2 | 3 | 1 | 10 | 11 | 2 | 12 | 0.28 | 0.21 | 0.14 |
57200431 | 57200437 | 6 | 6 | 3 | 9 | 0 | 37 | 37 | 6 | 40 | 0.79 | 0.20 | 0.13 |
57200431 | 57200478 | 47 | 4 | 1 | 5 | 1 | 12 | 13 | 5 | 13 | 0.72 | 0.28 | 0.28 |
57200431 | 57200495 | 64 | 6 | 0 | 6 | 10 | 11 | 21 | 16 | 11 | 0.44 | 0.22 | 0.41 |
57200431 | 57200500 | 69 | 6 | 0 | 6 | 8 | 14 | 22 | 14 | 14 | 0.52 | 0.21 | 0.50 |
57200431 | 57200514 | 83 | 1 | 1 | 2 | 1 | 11 | 12 | 2 | 12 | 0.42 | 0.14 | 0.14 |
57200437 | 57200478 | 41 | 2 | 0 | 2 | 1 | 8 | 9 | 3 | 8 | 0.77 | 0.18 | 0.27 |
57200437 | 57200495 | 58 | 3 | 0 | 3 | 10 | 10 | 20 | 13 | 10 | 0.34 | 0.13 | 0.43 |
57200437 | 57200500 | 63 | 3 | 0 | 3 | 7 | 15 | 22 | 10 | 15 | 0.45 | 0.12 | 0.40 |
57200465 | 57200472 | 7 | 33 | 3 | 36 | 4 | 20 | 24 | 37 | 23 | 0.76 | 0.40 | 0.38 |
57200465 | 57200478 | 13 | 7 | 27 | 34 | 2 | 13 | 15 | 9 | 40 | 0.09 | 0.31 | 0.18 |
57200465 | 57200495 | 30 | 8 | 3 | 11 | 0 | 3 | 3 | 8 | 6 | 0.60 | 0.21 | 0.43 |
57200465 | 57200512 | 47 | 1 | 9 | 10 | 1 | 4 | 5 | 2 | 13 | -0.14 | 0.33 | 0.13 |
57200465 | 57200514 | 49 | 1 | 9 | 10 | 2 | 3 | 5 | 3 | 12 | -0.35 | 0.33 | 0.20 |
57200465 | 57200519 | 54 | 4 | 7 | 11 | 1 | 4 | 5 | 5 | 11 | 0.16 | 0.31 | 0.31 |
57200465 | 57200525 | 60 | 3 | 7 | 10 | 2 | 2 | 4 | 5 | 9 | -0.19 | 0.29 | 0.36 |
57200465 | 57200527 | 62 | 1 | 9 | 10 | 1 | 3 | 4 | 2 | 12 | -0.19 | 0.29 | 0.14 |
57200465 | 57200536 | 71 | 2 | 6 | 8 | 1 | 3 | 4 | 3 | 9 | 0.00 | 0.33 | 0.25 |
57200472 | 57200478 | 6 | 10 | 31 | 41 | 1 | 21 | 22 | 11 | 52 | 0.25 | 0.35 | 0.17 |
57200472 | 57200495 | 23 | 12 | 3 | 15 | 2 | 8 | 10 | 14 | 11 | 0.59 | 0.40 | 0.44 |
57200472 | 57200500 | 28 | 6 | 4 | 10 | 3 | 4 | 7 | 9 | 8 | 0.17 | 0.41 | 0.47 |
57200472 | 57200512 | 40 | 2 | 6 | 8 | 0 | 3 | 3 | 2 | 9 | 0.29 | 0.27 | 0.18 |
57200472 | 57200514 | 42 | 2 | 6 | 8 | 1 | 2 | 3 | 3 | 8 | -0.08 | 0.27 | 0.27 |
57200472 | 57200519 | 47 | 4 | 5 | 9 | 0 | 3 | 3 | 4 | 8 | 0.41 | 0.25 | 0.33 |
57200472 | 57200525 | 53 | 4 | 5 | 9 | 1 | 2 | 3 | 5 | 7 | 0.10 | 0.25 | 0.42 |
57200472 | 57200527 | 55 | 2 | 7 | 9 | 0 | 3 | 3 | 2 | 10 | 0.26 | 0.25 | 0.17 |
57200472 | 57200536 | 64 | 4 | 5 | 9 | 0 | 4 | 4 | 4 | 9 | 0.44 | 0.31 | 0.31 |
57200478 | 57200495 | 17 | 6 | 1 | 7 | 14 | 20 | 34 | 20 | 21 | 0.34 | 0.17 | 0.49 |
57200478 | 57200500 | 22 | 6 | 1 | 7 | 9 | 17 | 26 | 15 | 18 | 0.42 | 0.21 | 0.45 |
57200495 | 57200500 | 5 | 16 | 14 | 30 | 9 | 20 | 29 | 25 | 34 | 0.23 | 0.49 | 0.42 |
57200495 | 57200519 | 24 | 2 | 8 | 10 | 0 | 9 | 9 | 2 | 17 | 0.33 | 0.47 | 0.11 |
57200500 | 57200525 | 25 | 2 | 5 | 7 | 1 | 5 | 6 | 3 | 10 | 0.14 | 0.46 | 0.23 |
57200512 | 57200525 | 13 | 3 | 1 | 4 | 8 | 18 | 26 | 11 | 19 | 0.31 | 0.13 | 0.37 |
57200512 | 57200527 | 15 | 2 | 2 | 4 | 3 | 19 | 22 | 5 | 21 | 0.33 | 0.15 | 0.19 |
57200512 | 57200536 | 24 | 3 | 0 | 3 | 2 | 12 | 14 | 5 | 12 | 0.72 | 0.18 | 0.29 |
57200514 | 57200519 | 5 | 3 | 4 | 7 | 6 | 29 | 35 | 9 | 33 | 0.23 | 0.17 | 0.21 |
57200514 | 57200525 | 11 | 4 | 2 | 6 | 7 | 19 | 26 | 11 | 21 | 0.33 | 0.19 | 0.34 |
57200514 | 57200527 | 13 | 2 | 4 | 6 | 3 | 19 | 22 | 5 | 23 | 0.21 | 0.21 | 0.18 |
57200514 | 57200536 | 22 | 3 | 1 | 4 | 2 | 13 | 15 | 5 | 14 | 0.57 | 0.21 | 0.26 |
57200519 | 57200525 | 6 | 3 | 6 | 9 | 8 | 16 | 24 | 11 | 22 | 0.00 | 0.27 | 0.33 |
57200519 | 57200527 | 8 | 1 | 7 | 8 | 4 | 17 | 21 | 5 | 24 | -0.08 | 0.28 | 0.17 |
57200519 | 57200536 | 17 | 3 | 5 | 8 | 2 | 10 | 12 | 5 | 15 | 0.24 | 0.40 | 0.25 |
57200525 | 57200527 | 2 | 4 | 6 | 10 | 1 | 20 | 21 | 5 | 26 | 0.45 | 0.32 | 0.16 |
57200525 | 57200536 | 11 | 5 | 3 | 8 | 0 | 14 | 14 | 5 | 17 | 0.72 | 0.36 | 0.23 |
57200527 | 57200536 | 9 | 3 | 0 | 3 | 2 | 17 | 19 | 5 | 17 | 0.73 | 0.14 | 0.23 |